Lors de l'homélie qu'il a donnée le Jeudi saint, pendant la messe chrismale, le Saint-Père a engagé de manière surprenante (pour une telle circonstance) son autorité en évoquant le problème de l'obéissance des prêtres dans l'Église. Il a très clairement visé des mouvements réclamant l'ordination sacerdotale des femmes alors que la question a été définitivement tranchée par son prédécesseur le pape Jean-Paul II. S'il n'a pas donné de noms, Benoît XVI a parlé de « prêtres dans un pays européen », visant ainsi l'Autriche. Il aurait aussi pu parler de l'Allemagne, sa propre nation, dans laquelle des groupes de catholiques ont fait profession de contester le magistère de l'Église.